بر اساس نظام رتبه‌بندی لایدن دانشگاه صنعتی اصفهان در صدر دانشگاه‌های ایران از نظر شاخص مرجعیت علمی و همچنین میزان همکاری‌های علمی بین‌المللی قرار گرفت. نظام رتبه بندی لایدن یک از معتبرترین نظام های رتبه بندی بین المللی و وابسته به مرکز مطالعات علم و فناوری دانشگاه لایدن در هلند است. لایدن برای چهارمین دوره متوالی به معرفی برترین دانشگاه‌های بین المللی پرداخته است. در رتبه بندی سال 2015 لایدن 750 دانشگاه برتر جهان را شناسایی، ارزیابی و مورد رتبه بندی قرار داده است که 13 دانشگاه از ایران در فهرست این 750 دانشگاه برتر دنیا قرار گرفته اند. مرجعیت و دیپلماسی علمی دو رکن اساسی این رتبه بندی هستند. بر اساس این رتبه بندی، دانشگاه صنعتی اصفهان برحسب شاخص مرجعیت علمی (میزان تولیدات علمی که در دسته ۱۰درصد برتر تولیدات علمی دنیا قرار گرفته اند) و بر حسب شاخص دیپلماسی علمی (میزان همکاری های علمی بین المللی) در صدر سایر دانشگاه‌های ایرانی حاضر در این رتبه‌بندی قرار گرفته است. همچنین بر حسب شاخص میزان ارتباط با صنعت، دانشگاه صنعتی اصفهان با کسب رتبه 708 پس از دانشگاه‌های تهران، صنعتی شریف، صنعتی امیرکبیر، تربیت مدرس و فردوسی مشهد در رده ششم دانشگاه‌های ایرانی حاضر در این رتبه‌بندی قرار گرفته است.